Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND25

ZNRF1, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF1Q8ND25 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF1Q8ND25 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms