Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RDH13Q8NBN7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDH13Q8NBN7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDH13Q8NBN7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDH13Q8NBN7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDH13Q8NBN7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDH13Q8NBN7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDH13Q8NBN7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDH13Q8NBN7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDH13Q8NBN7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDH13Q8NBN7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDH13Q8NBN7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RDH13Q8NBN7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RDH13Q8NBN7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RDH13Q8NBN7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RDH13Q8NBN7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RDH13Q8NBN7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RDH13Q8NBN7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RDH13Q8NBN7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RDH13Q8NBN7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RDH13Q8NBN7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RDH13Q8NBN7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDH13Q8NBN7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDH13Q8NBN7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDH13Q8NBN7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDH13Q8NBN7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDH13Q8NBN7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDH13Q8NBN7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDH13Q8NBN7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDH13Q8NBN7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDH13Q8NBN7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDH13Q8NBN7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDH13Q8NBN7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDH13Q8NBN7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms