Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA2D3Q8IZS8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms