Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms