Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVJ8

APRG1, AP20 region protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APRG1Q8IVJ8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APRG1Q8IVJ8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms