Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM139Q8IV31 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM139Q8IV31 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 885.1 ms