Protein–RNA interactions for Protein: Q86VL8

SLC47A2, Multidrug and toxin extrusion protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC47A2Q86VL8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC47A2Q86VL8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC47A2Q86VL8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms