Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
PBRM1Q86U86 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
PBRM1Q86U86 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms