Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01551Q86U37 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01551Q86U37 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms