Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT27Q7Z3Y8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms