Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEGR1Q7Z3B1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEGR1Q7Z3B1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEGR1Q7Z3B1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms