Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTOP3Q7RTS5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTOP3Q7RTS5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms