Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NLRP9Q7RTR0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms