Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARCQ7LC44 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCQ7LC44 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms