Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RUFY3Q7L099 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms