Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP43Q70EL4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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