Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00173Q6ZV60 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms