Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT9

DENND5B, DENN domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND5BQ6ZUT9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DENND5BQ6ZUT9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND5BQ6ZUT9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms