Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN1Q6NZI2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms