Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRNP1Q6NT89 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRNP1Q6NT89 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms