Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC70Q6NSX1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC70Q6NSX1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms