Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC19Q6DKK2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC19Q6DKK2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms