Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKR9

FAM104B, Protein FAM104B, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM104BQ5XKR9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM104BQ5XKR9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms