Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CHIC1Q5VXU3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CHIC1Q5VXU3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms