Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BROXQ5VW32 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BROXQ5VW32 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BROXQ5VW32 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BROXQ5VW32 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
BROXQ5VW32 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BROXQ5VW32 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BROXQ5VW32 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BROXQ5VW32 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BROXQ5VW32 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BROXQ5VW32 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BROXQ5VW32 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BROXQ5VW32 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BROXQ5VW32 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BROXQ5VW32 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BROXQ5VW32 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BROXQ5VW32 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BROXQ5VW32 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BROXQ5VW32 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BROXQ5VW32 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BROXQ5VW32 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BROXQ5VW32 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BROXQ5VW32 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BROXQ5VW32 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BROXQ5VW32 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BROXQ5VW32 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BROXQ5VW32 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BROXQ5VW32 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BROXQ5VW32 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BROXQ5VW32 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BROXQ5VW32 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BROXQ5VW32 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
BROXQ5VW32 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BROXQ5VW32 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BROXQ5VW32 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BROXQ5VW32 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BROXQ5VW32 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BROXQ5VW32 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BROXQ5VW32 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BROXQ5VW32 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BROXQ5VW32 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BROXQ5VW32 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BROXQ5VW32 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BROXQ5VW32 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BROXQ5VW32 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BROXQ5VW32 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BROXQ5VW32 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BROXQ5VW32 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BROXQ5VW32 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BROXQ5VW32 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BROXQ5VW32 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BROXQ5VW32 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BROXQ5VW32 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BROXQ5VW32 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BROXQ5VW32 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BROXQ5VW32 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BROXQ5VW32 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BROXQ5VW32 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BROXQ5VW32 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
BROXQ5VW32 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BROXQ5VW32 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BROXQ5VW32 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BROXQ5VW32 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BROXQ5VW32 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BROXQ5VW32 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BROXQ5VW32 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BROXQ5VW32 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BROXQ5VW32 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BROXQ5VW32 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BROXQ5VW32 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BROXQ5VW32 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms