Protein–RNA interactions for Protein: Q5T890

ERCC6L2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6L2Q5T890 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ERCC6L2Q5T890 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
ERCC6L2Q5T890 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERCC6L2Q5T890 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms