Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NHSL1Q5SYE7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NHSL1Q5SYE7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NHSL1Q5SYE7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NHSL1Q5SYE7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NHSL1Q5SYE7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NHSL1Q5SYE7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NHSL1Q5SYE7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NHSL1Q5SYE7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NHSL1Q5SYE7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms