Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 314.2 ms