Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4orf46Q504U0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4orf46Q504U0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms