Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms