Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVEP1Q4LDE5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms