Protein–RNA interactions for Protein: Q4JDL3

PTPN20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN20Q4JDL3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN20Q4JDL3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN20Q4JDL3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms