Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUSP28Q4G0W2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms