Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM30BQ3MIR4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms