Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RPEL1Q2QD12 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPEL1Q2QD12 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms