Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms