Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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