Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCSK7Q16549 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK7Q16549 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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