Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMA4Q16363 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
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