Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPTX1Q15818 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms