Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TWIST1Q15672 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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TWIST1Q15672 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TWIST1Q15672 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TWIST1Q15672 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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TWIST1Q15672 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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TWIST1Q15672 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TWIST1Q15672 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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TWIST1Q15672 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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TWIST1Q15672 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TWIST1Q15672 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWIST1Q15672 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWIST1Q15672 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWIST1Q15672 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWIST1Q15672 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWIST1Q15672 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWIST1Q15672 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWIST1Q15672 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TWIST1Q15672 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWIST1Q15672 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWIST1Q15672 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWIST1Q15672 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWIST1Q15672 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TWIST1Q15672 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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