Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SF1Q15637 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SF1Q15637 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SF1Q15637 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SF1Q15637 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SF1Q15637 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SF1Q15637 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SF1Q15637 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SF1Q15637 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SF1Q15637 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SF1Q15637 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SF1Q15637 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SF1Q15637 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SF1Q15637 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SF1Q15637 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SF1Q15637 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF1Q15637 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF1Q15637 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SF1Q15637 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SF1Q15637 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SF1Q15637 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF1Q15637 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF1Q15637 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF1Q15637 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF1Q15637 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF1Q15637 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SF1Q15637 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SF1Q15637 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SF1Q15637 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SF1Q15637 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SF1Q15637 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SF1Q15637 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SF1Q15637 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SF1Q15637 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SF1Q15637 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SF1Q15637 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SF1Q15637 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SF1Q15637 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SF1Q15637 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SF1Q15637 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SF1Q15637 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SF1Q15637 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SF1Q15637 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SF1Q15637 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SF1Q15637 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SF1Q15637 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SF1Q15637 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SF1Q15637 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SF1Q15637 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SF1Q15637 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SF1Q15637 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SF1Q15637 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SF1Q15637 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SF1Q15637 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SF1Q15637 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SF1Q15637 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SF1Q15637 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SF1Q15637 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF1Q15637 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF1Q15637 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF1Q15637 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF1Q15637 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF1Q15637 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF1Q15637 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SF1Q15637 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SF1Q15637 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF1Q15637 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SF1Q15637 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF1Q15637 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF1Q15637 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF1Q15637 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF1Q15637 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF1Q15637 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF1Q15637 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF1Q15637 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF1Q15637 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SF1Q15637 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF1Q15637 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SF1Q15637 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF1Q15637 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SF1Q15637 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF1Q15637 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF1Q15637 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF1Q15637 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF1Q15637 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF1Q15637 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF1Q15637 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF1Q15637 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF1Q15637 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF1Q15637 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF1Q15637 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF1Q15637 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF1Q15637 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF1Q15637 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF1Q15637 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF1Q15637 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF1Q15637 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SF1Q15637 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF1Q15637 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF1Q15637 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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