Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TAF1AQ15573 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1AQ15573 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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