Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
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