Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.878e-12■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 PCED1A-205ENST00000474714 531 ntTSL 316.3■□□□□ 0.28e-12■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 MRPL38-212ENST00000486101 767 ntTSL 213.41□□□□□ -0.261e-8■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 SLC7A8-209ENST00000528186 590 ntTSL 213.32□□□□□ -0.282e-12■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 PCED1A-206ENST00000487501 712 ntTSL 312.84□□□□□ -0.358e-12■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 SLC7A8-210ENST00000528806 735 ntTSL 212□□□□□ -0.492e-12■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 AP000781.2-201ENST00000534081 1639 ntTSL 215.03■□□□□ -01e-7■■■■■ 28.2
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PCBP1Q15365 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.827e-9■■■■■ 28.1
PCBP1Q15365 CDC25B-206ENST00000467519 1960 ntTSL 1 (best)19.33■□□□□ 0.698e-7■■■■■ 28.1
PCBP1Q15365 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.48e-7■■■■■ 28.1
PCBP1Q15365 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.118e-7■■■■■ 28.1
PCBP1Q15365 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.128e-7■■■■■ 28.1
PCBP1Q15365 CDC25B-201ENST00000245960 3597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.478e-7■■■■■ 28.1
PCBP1Q15365 PDCD6IPP2-204ENST00000564604 559 ntTSL 423.54■■□□□ 1.363e-6■■■■■ 28.1
PCBP1Q15365 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 28.1
PCBP1Q15365 HDAC7-208ENST00000425451 621 ntTSL 519.58■□□□□ 0.723e-7■■■■■ 28.1
PCBP1Q15365 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 28.1
PCBP1Q15365 MICAL3-207ENST00000461307 5981 ntTSL 513.05□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 28.1
PCBP1Q15365 MICAL3-203ENST00000400561 3046 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 28.1
PCBP1Q15365 MICAL3-210ENST00000495076 5113 ntTSL 511.3□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 28.1
PCBP1Q15365 MICAL3-202ENST00000383094 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 28.1
PCBP1Q15365 MICAL3-204ENST00000414725 4756 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 28.1
PCBP1Q15365 MICAL3-219ENST00000585038 3323 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.052e-6■■■■■ 28.1
PCBP1Q15365 PTMS-205ENST00000540828 644 ntTSL 1 (best)23.47■■□□□ 1.359e-66■■■■■ 28.1
PCBP1Q15365 CD74-206ENST00000518797 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.56■□□□□ 0.086e-7■■■■■ 28.1
PCBP1Q15365 CD74-203ENST00000377795 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 28.1
PCBP1Q15365 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.146e-7■■■■■ 28.1
PCBP1Q15365 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 11e-12■■■■■ 28
PCBP1Q15365 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.721e-12■■■■■ 28
PCBP1Q15365 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.511e-12■■■■■ 28
PCBP1Q15365 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.421e-12■■■■■ 28
PCBP1Q15365 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.211e-12■■■■■ 28
PCBP1Q15365 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 01e-12■■■■■ 28
PCBP1Q15365 TPGS2-210ENST00000590258 2679 ntTSL 210.65□□□□□ -0.71e-12■■■■■ 28
PCBP1Q15365 TPGS2-204ENST00000587129 841 ntTSL 4 BASIC8.51□□□□□ -1.051e-12■■■■■ 28
PCBP1Q15365 TPGS2-218ENST00000591906 936 ntTSL 38.14□□□□□ -1.111e-12■■■■■ 28
PCBP1Q15365 TPGS2-206ENST00000587382 2079 ntTSL 37.89□□□□□ -1.151e-12■■■■■ 28
PCBP1Q15365 TPGS2-213ENST00000590652 515 ntTSL 55.46□□□□□ -1.541e-12■■■■■ 28
PCBP1Q15365 SRCAP-202ENST00000395059 9126 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 28
PCBP1Q15365 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 28
PCBP1Q15365 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 28
PCBP1Q15365 SMG7-204ENST00000419169 2483 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.71■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 28
PCBP1Q15365 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 28
PCBP1Q15365 SLC7A8-204ENST00000422941 3018 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 28
PCBP1Q15365 SLC7A8-201ENST00000316902 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.671e-6■■■■■ 28
PCBP1Q15365 SLC7A8-206ENST00000469263 3557 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -11e-6■■■■■ 28
PCBP1Q15365 SLC7A8-202ENST00000339733 3066 ntTSL 1 (best)8.6□□□□□ -1.031e-6■■■■■ 28
PCBP1Q15365 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.875e-7■■■■■ 28
PCBP1Q15365 ICAM5-205ENST00000588912 928 nt22.66■■□□□ 1.229e-9■■■■■ 28
PCBP1Q15365 ICAM5-202ENST00000586004 567 ntTSL 422.38■■□□□ 1.179e-9■■■■■ 28
PCBP1Q15365 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.899e-9■■■■■ 28
PCBP1Q15365 SLC7A8-203ENST00000397310 2719 ntTSL 210.31□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 28
PCBP1Q15365 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.246e-13■■■■■ 27.9
PCBP1Q15365 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.696e-13■■■■■ 27.9
PCBP1Q15365 MNT-206ENST00000574559 580 ntTSL 421.14■□□□□ 0.976e-13■■■■■ 27.9
PCBP1Q15365 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.776e-13■■■■■ 27.9
PCBP1Q15365 CHERP-202ENST00000544299 1755 ntTSL 219.55■□□□□ 0.726e-13■■■■■ 27.9
PCBP1Q15365 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.696e-13■■■■■ 27.9
PCBP1Q15365 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.616e-13■■■■■ 27.9
PCBP1Q15365 CHERP-203ENST00000546361 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.446e-13■■■■■ 27.9
PCBP1Q15365 CHERP-201ENST00000198939 4084 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.746e-13■■■■■ 27.9
PCBP1Q15365 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.297e-7■■■■■ 27.9
PCBP1Q15365 ARF3-204ENST00000485410 563 ntTSL 321.45■■□□□ 1.027e-7■■■■■ 27.9
PCBP1Q15365 FADS2-208ENST00000521571 799 ntTSL 37.67□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 27.9
PCBP1Q15365 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.756e-8■■■■■ 27.9
PCBP1Q15365 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.486e-8■■■■■ 27.9
PCBP1Q15365 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.26e-8■■■■■ 27.9
PCBP1Q15365 CYB5R3-208ENST00000470741 3938 ntTSL 1 (best)13.64□□□□□ -0.236e-8■■■■■ 27.9
PCBP1Q15365 CYB5R3-202ENST00000361740 2938 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.626e-8■■■■■ 27.9
PCBP1Q15365 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.13e-8■■■■■ 27.8
PCBP1Q15365 SLC2A4RG-203ENST00000474248 624 ntTSL 225.5■■□□□ 1.675e-6■■■■■ 27.8
PCBP1Q15365 SLC2A4RG-205ENST00000485897 518 ntTSL 524.82■■□□□ 1.565e-6■■■■■ 27.8
PCBP1Q15365 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 27.8
PCBP1Q15365 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 27.8
PCBP1Q15365 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.292e-14■■■■■ 27.8
PCBP1Q15365 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.272e-14■■■■■ 27.8
PCBP1Q15365 APOC3-201ENST00000227667 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.52e-14■■■■■ 27.8
PCBP1Q15365 BUD23-206ENST00000430270 1260 ntTSL 520.79■□□□□ 0.921e-8■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.921e-8■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 BUD23-213ENST00000463307 1815 ntTSL 1 (best)15.06■□□□□ 01e-8■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.011e-8■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 BUD23-209ENST00000436944 2496 ntTSL 214.69□□□□□ -0.061e-8■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 BUD23-207ENST00000430446 738 ntTSL 314.31□□□□□ -0.121e-8■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 BUD23-212ENST00000453316 452 ntTSL 313.95□□□□□ -0.181e-8■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 BUD23-211ENST00000442099 691 ntTSL 313.67□□□□□ -0.221e-8■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 FTL-201ENST00000331825 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.262e-30■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 BUD23-215ENST00000471215 3886 ntTSL 210.15□□□□□ -0.781e-8■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.053e-14■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.493e-14■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.16□□□□□ -1.583e-14■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.155e-50■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.396e-88■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 FTH1-206ENST00000530019 550 ntTSL 417.48■□□□□ 0.396e-88■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.396e-88■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 FTH1-210ENST00000534180 983 ntTSL 215.1■□□□□ 0.016e-88■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.166e-88■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 FTH1-208ENST00000532829 912 ntTSL 214.05□□□□□ -0.166e-88■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 FTH1-203ENST00000529191 530 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.416e-88■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 FTH1-212ENST00000620041 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.936e-88■■■■■ 27.7
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