Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RABEP1Q15276 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABEP1Q15276 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RABEP1Q15276 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
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