Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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PTPRRQ15256 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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PTPRRQ15256 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPRRQ15256 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRRQ15256 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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