Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NECTIN1Q15223 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECTIN1Q15223 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
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