Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRLQ15198 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFRLQ15198 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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