Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
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